Главному герою, ученые сделали предложение об участие в большой экспедиции в глубину зоны. Его задачей должно было быть сопровождение группы ученых в заброшенный подземный комплекс и сбор информации, которая могла там находиться. Но проблема в том, что наш герой не был в Зоне около шести лет и не знает всю нынешнюю обстановку внутри периметра. Для того чтобы он освоился перед экспедицией, ученые ему предложили самому от границы зоны добраться до научного лагеря.
По ходу сюжетной линии игрок узнает, что будет ждать главного героя на пути к лагерю ученых и куда его хотят направить с целой экспедицией?